一、對于藥廠(chǎng)設計來(lái)說(shuō)，生物制品有菌（毒）操作區與無(wú)菌（毒）操作區應有各自獨立的空氣凈化系統。來(lái)自病原體操作區的空氣不得循環(huán)使用，來(lái)自危險度為二類(lèi)以上病原體的空氣應通過(guò)除菌過(guò)濾器排放。
二、下列場(chǎng)合，其空氣凈化系統不得回風(fēng)。
a.產(chǎn)生易燃易爆氣體的生產(chǎn)操作間，如使用溶劑的原料精制、干燥，使用酒精的片劑包衣和濕法制粒、干燥等
b.產(chǎn)生大量濕熱蒸汽的場(chǎng)合，如需要加熱至沸的藥液配制。
c.產(chǎn)生粉塵的生產(chǎn)操作間，如固體制劑物料的粉篩、稱(chēng)量、混合、制粒、整粒、壓片、膠囊充填、顆粒包裝等均需考慮捕塵處理，如經(jīng)捕塵處理仍不能避免交叉污染時(shí)，其空氣凈化不得利用回風(fēng)。
d.產(chǎn)生有毒有害物質(zhì)的生產(chǎn)操作間，如病原體操作區必要時(shí)排至室外的廢氣要采取高效過(guò)濾器凈化，如青霉素類(lèi)、激素類(lèi)、危險度為二類(lèi)以上病原體操作區等的排氣應經(jīng)高效過(guò)濾器凈化
三、青霉素等高致敏性藥品的精制、干燥和分裝，強毒微生物操作區，芽孢菌制品操作區，產(chǎn)塵量大的操作室，如固體制劑的稱(chēng)量、粉篩、制粒、壓片、填充膠囊等，應與室外保持微正壓，與鄰室保持相對負壓。
四、生產(chǎn)中的藥渣、煤渣必須隔離堆場(chǎng)，及時(shí)外運，不得對廠(chǎng)區環(huán)境產(chǎn)生污染。生產(chǎn)、工作中產(chǎn)生的垃圾應放在密閉容器或袋中，垃圾轉運站要遠離生產(chǎn)區，并及時(shí)外運，廠(chǎng)區內不準堆存垃圾，最好不設置垃圾轉運站，保持隨時(shí)有，隨時(shí)外運。
五、工藝設備材質(zhì)應保證不會(huì )與藥物或空氣和水發(fā)生化學(xué)反應。
六、輸送藥液、純化水、注射用水的管道要有防止微生物滋生和污染的措施，如循環(huán)、保溫（冷）等，管道布置要求不積液、不積氣，要考慮消毒或滅菌設施（純蒸汽、臭氧、紫外、巴氏），并采用衛生型閥門(mén)。
七、無(wú)菌作業(yè)區不得設置地漏，其他潔凈室（區）也要盡量少設地漏，如固體制劑車(chē)間除清洗區外，潔凈室（區）內最好不設地漏，以免地漏周?chē)睗竦目諝馕椒蹓m，造成難以克服的污染。