一個(gè)制藥工程項目從計劃建設到交付生產(chǎn)一般要經(jīng)歷以下基本工作程序:項目建議書(shū)→批準立項→可行性研究→設計任務(wù)書(shū)→初步設計→設計中審→施工圖設計→施工一試車(chē)→竣工→驗收→交付生產(chǎn)。
上述工作程序大致可分為3個(gè)階段:藥廠(chǎng)設計前期、藥廠(chǎng)設計期、藥廠(chǎng)設計后期。藥廠(chǎng)設計前期主要包括項目建議書(shū)、可行性研究和設計任務(wù)書(shū)；藥廠(chǎng)設計期主要包括初步設計和施工圖設計；施工、試車(chē)、竣工驗收和交付生產(chǎn)等，統稱(chēng)為藥廠(chǎng)設計后期。
藥廠(chǎng)設計人員應按照設計工作基本程序開(kāi)展工作，但由于工程項目的生產(chǎn)規模、所處地區、建設資金、技術(shù)成熟程度和設計水平等因素的差異，設計工作程序可能有所變化。例如，對于一些技術(shù)成熟又較為簡(jiǎn)單的小型項目（小型制劑生產(chǎn)廠(chǎng)、個(gè)別生產(chǎn)車(chē)間或設備的技術(shù)改造等），工程技術(shù)人員可按設計工作的基本程序進(jìn)行合理簡(jiǎn)化，以縮短設計時(shí)間。藥廠(chǎng)車(chē)間工藝設計的基本過(guò)程一般分為初步設計和施工圖設計兩個(gè)階段；對于技術(shù)復雜或缺乏設計經(jīng)驗的重大項目，經(jīng)主管部門(mén)和業(yè)主確定，可在設計前期之后進(jìn)行設計期的工作；技術(shù)簡(jiǎn)單的小型項目，在初步設計確定后即可進(jìn)行施工圖設計。
藥廠(chǎng)工藝設計是制藥工程設計的主要環(huán)節，工藝設計的好壞直接影響生產(chǎn)和技術(shù)的合理性，并且與建設費用、藥品生產(chǎn)質(zhì)量、產(chǎn)品成本、勞動(dòng)強度等都有密切的關(guān)系，同時(shí)工藝設計又是其他非工藝設計的依據。
藥廠(chǎng)車(chē)間工藝設計的主要內容有:
（1）確定生產(chǎn)工藝流程
（2）進(jìn)行物料計算。
（3）工藝設備選型和計算。
（4）車(chē)間工藝設備布置。
（5）確定勞動(dòng)定員及生產(chǎn)班制
（6）車(chē)間水、電、氣（汽）、冷公用工程用量的估算。
（7）管路計算和設計
（8）設計說(shuō)明書(shū)的編寫(xiě)
（9）概預算的編寫(xiě)。
（10）非工藝項目的設計。
通過(guò)藥廠(chǎng)工藝設計，應使制藥生產(chǎn)車(chē)間在工藝技術(shù)、設備布置和選型、勞動(dòng)組織等方面能保證設計項目投產(chǎn)后正常生產(chǎn)、經(jīng)濟適用，符合GMP，并在產(chǎn)品的數量上和質(zhì)量上達到設計要求。