醫藥廠(chǎng)房項目建設單位（甲方）應根據批準的基建計劃和設計文件，努力創(chuàng )造良好的施工條件，并做好施工前的各項準備工作。例如，提出物資和設備申請計劃、落實(shí)建筑材料來(lái)源、辦理征地拆遷手續、落實(shí)水電及道路等外部施工條件和施工力量。具備施工條件后，一般應根據設計概算或施工圖預算制定標底，通過(guò)公開(kāi)招標方式選擇施工單位。
施工單位應根據醫藥廠(chǎng)房設計單位提供的施工圖，編制好施工預算和施工組織計劃。醫藥廠(chǎng)房施工前要認真做好施工圖的會(huì )審工作。會(huì )審一般由醫藥廠(chǎng)房建設單位、醫藥廠(chǎng)房設計單位和施工單位三方共同參加，其目的是澄清圖紙中的不清之處或存在的問(wèn)題，并明確工程質(zhì)量要求施工單位應嚴格按照設計要求和施工驗收規范進(jìn)行施工，對施工過(guò)程中可能發(fā)生質(zhì)量事故的環(huán)節、時(shí)期應及早研究，并采取相應的預防措施，確保工程質(zhì)量萬(wàn)無(wú)一失。
醫藥廠(chǎng)房項目在完成施工后，應及時(shí)組織專(zhuān)門(mén)機構抓好裝置的調試與試車(chē)工作。根據實(shí)際情況，制藥裝置的調試有多種方法，但總的原則是:從單機到聯(lián)機到整條生產(chǎn)線(xiàn)；從空車(chē)到以水代料到實(shí)際物料當以實(shí)際物料試車(chē)，并生產(chǎn)出合格產(chǎn)品（藥品），且達到裝置的設計要求時(shí)，制藥工程項目即告竣工。此時(shí)，應及時(shí)組織竣工驗收。
大型醫藥廠(chǎng)房工程項目，由國家發(fā)改委組織驗收。中、小型工程項目，按隸屬關(guān)系由國家主管部門(mén)或省、市、自治區組織驗收。
竣工項目驗收前，建設單位要組織設計、施工等單位，按照工程承建合同、施工技術(shù)文件及工程驗收規范（如潔凈室施工及驗收規范、采暖與衛生工程施工及驗收規范等）先行驗收，向主管部門(mén)提出竣工驗收報告，并系統整理技術(shù)資料，繪制竣工圖，在竣工驗收合格后作為技術(shù)檔案，移交生產(chǎn)單位保存。建設單位還要編好工程竣工決算書(shū)，報上級主管部門(mén)審查?？⒐を炇蘸细窈蟮纳a(chǎn)裝置，即可交付使用方，形成產(chǎn)品的生產(chǎn)能力。
可見(jiàn)，醫藥廠(chǎng)房施工圖設計完成后，醫藥廠(chǎng)房設計單位并沒(méi)有完全完成設計任務(wù)，設計人員（代表）還要參加現場(chǎng)施工、試車(chē)、驗收和投產(chǎn)工作。若有涉及設計方案的重大問(wèn)題應及時(shí)向上級和有關(guān)設計人員匯報，請示處理意見(jiàn)。當制藥工程項目投入正常生產(chǎn)后，設計人員還要對工程設計進(jìn)行全面總結，為以后的醫藥廠(chǎng)房設計提供經(jīng)驗。