由于凈化空調系統的特點(diǎn)和普通空調系統不同，因此空氣處理過(guò)程和空氣處理的參數也不同，在選擇空調箱時(shí)，必須滿(mǎn)足凈化空調系統的要求。
空調箱必須具備初、中效二級過(guò)濾的功能。初、中效過(guò)濾器要根據凈化空調系統對潔凈度的要求和工程所在地室外環(huán)境的大氣含塵濃度來(lái)選擇過(guò)濾效率（過(guò)濾級別）。還要考慮初、中效過(guò)濾器的阻力和容塵量。初、中效過(guò)濾的阻力分初阻力和終阻力，選擇空調箱的風(fēng)機時(shí)應按它的終阻力來(lái)計算容塵量，也就是初、中效過(guò)濾器的使用壽命。初、中效過(guò)濾器還分可清洗的和不可清洗的兩種選擇時(shí)應根據工程的具體情況和業(yè)主的要求來(lái)選擇。
因為多級過(guò)濾器的阻力很大，表冷器的排數多，阻力也增大，所以?xún)艋照{系統的空調箱所選用的風(fēng)機風(fēng)壓要比普通空調系統高許多，空調箱的壁板承受的壓力也就大多了。凈化空調系統對漏風(fēng)量的控制也應比普通空調系統更嚴格，因為系統的漏風(fēng)不僅影響室內的溫濕度或造成能源浪費，還會(huì )影響潔凈室的潔凈度，因此對凈化空調系統的空調箱結構要求更高，無(wú)論是板式還是框架式結構都要求變形量最小。
由于工藝需要，凈化空調系統往往是室內的溫、濕度基數比普通空調要低，因此送風(fēng)狀態(tài)點(diǎn)的溫度也相應比較低。為了讓空調箱箱壁不結露，對空調箱箱壁保溫材料的厚度和傳熱系數的要求更高，空調箱連接點(diǎn)的冷橋處理要求更高，必要時(shí)要做結露校核計算。
潔凈空調設計規范規定潔凈室內的噪聲不高于60dB。凈化空調系統的風(fēng)量比普通空調系統的風(fēng)量要大，風(fēng)系統的阻力也大，選用的送風(fēng)機風(fēng)量大，風(fēng)壓也大，風(fēng)機轉速也要高，所以產(chǎn)生的噪聲也就大。為了滿(mǎn)足規范的要求，往往還要在空調箱內設置消聲器。為了避免消聲器的吸聲材料成為發(fā)塵源，一般在凈化空調系統的空調箱內都選用微穿孔板消聲器。微穿孔板消聲器的消聲量要根據消聲器的長(cháng)度計算。
凈化空調系統的空調箱加濕器的選擇在前面已經(jīng)陳述過(guò)了，但要考慮空調箱加濕段內是否要加擋水板，以免有水滴進(jìn)入風(fēng)機段和中效過(guò)濾器段。