在食品工廠(chǎng)設計裝修中，潔凈室凈化空調系統通過(guò)對空氣的過(guò)濾處理，從而保證了所需要的潔凈度。生物潔凈室需要同時(shí)控制室內的塵埃粒子數及浮游菌和沉降菌，如果不采取必要的消毒措施，僅僅通過(guò)凈化空調系統的三級過(guò)濾處理，將難以長(cháng)期控制室內的微生物數。
潔凈室凈化空調系統的二次微生物污染問(wèn)題越來(lái)越受到廣泛的重視，空調處理裝置在運行中必然積累細菌和塵埃，一旦系統停止運行，高溫和高濕的環(huán)境將為微生物的繁殖提供很有利的條件，大量繁殖的微生物及其釋放出的有害物質(zhì)、有害代謝物、尸體和碎片等很大一部分是過(guò)濾器無(wú)法阻擋的，這將造成微生物的二次污染。
同樣在潔凈室內由于人員的活動(dòng)、物品的出入，凈化空調系統也不可能完全將所有的塵埃和微生物都帶出潔凈室，一部分微生物將會(huì )在潔凈室內繼續繁殖，造成污染。
而對于生物安全潔凈室而言，由于研究對象的高度危險性，防止實(shí)驗室內的工作人員和實(shí)驗室外的環(huán)境受到污染是一切工作的重點(diǎn)，凈化空調系統必須具有相應的消毒措施，才能保證操作維護人員的安全。
因此，凈化空調系統和潔凈室必須采取妥善的消毒措施和方法，才能保證生物潔凈室和生物安全潔凈室達到使用要求。
傳統的生物潔凈室通常采用化學(xué)試劑消毒，這種方法藥味大，難以自然排出，需要空調長(cháng)時(shí)間置換新風(fēng)。同時(shí)也存在二次污染的問(wèn)題，剩余的藥物直接排入大氣，造成對周?chē)h(huán)境的污染。如甲醛熏蒸，操作麻煩，熏蒸時(shí)間長(cháng)，有二次污染物，對人體有一定的危害。做一次甲熏蒸需8個(gè)小時(shí)，殘留物附著(zhù)潔凈的墻壁上和設備的表面上，需要擦除。在消毒后的幾天內，其懸浮粒子數會(huì )增加，對高效過(guò)濾器有一定的損傷。更重要是的是這樣的消毒、滅菌方式難以對空氣處理裝置、排風(fēng)高效過(guò)濾器（高等級生物安全潔凈室要求）和風(fēng)管進(jìn)行消毒。
近年來(lái)臭氧（O3）消毒法越來(lái)越多的得到了應用?？茖W(xué)研究表明，臭氧具有強烈的殺菌作用，臭氧在常溫、常壓下分子結構不穩定，很快自行分解成氧氣（O2）和單個(gè)氧原子（O）；后者具有很強的氧化性，對細菌有極強的氧化作用，臭氧氧化分解了細菌內部氧化葡萄糖所必須的酶，從而破壞其細胞膜，將它殺死，多余的氧原子則會(huì )自行重新結合成為普通氧原子（O2），不存在任何有毒殘留物，故稱(chēng)無(wú)污染消毒劑，它不但對各種細菌（包括肝炎病毒，大腸桿菌，綠濃桿菌及雜菌等）有極強的殺滅能力，而且對殺死霉素也很有效。臭氧水比臭氧氣體具有更強的氧化能力，對細菌、孢囊、芽孢菌、病毒等有更強的殺滅能力，殺菌速度比氯快200～3000倍，甚至幾秒鐘內可以致死細菌。對單細胞的藻類(lèi)植物殺滅更快。很多研究和驗證表明了其強大的殺菌能力。
臭氧消毒的特點(diǎn)為:
（1）較高的擴散性：臭氧為氣體，擴散性好，無(wú)死角，濃度分布均勻。
（2）殺菌能力強：臭氧殺菌能力與過(guò)氧乙酸相當，高于其它消毒劑。
（3）廣譜性：適合多種致病微生物，對大腸桿菌、沙門(mén)氏菌、金黃色葡萄球菌及甲乙型肝炎病毒、真菌等多種微生物均有很好的殺滅作用。
（4）原料易得：臭氧制備是利用我們周?chē)拇髿庵迫?，不需儲藏設施，節省原料儲存所需的占地面積。
（5）環(huán)保性：臭氧能快速分解成氧氣和單原子氧，單原子氧又可自身結合成氧分子，故沒(méi)有二次污染的問(wèn)題。被公認為是綠色消毒劑。
臭氧的殺菌效果在濕度為50-80％條件下效果最理想，這主要是病毒、細菌在高濕條件下細胞壁較疏松，易被臭氧穿透殺滅，在濕度低于30％時(shí)效果較差，所以在使用中應特別注意。根據《消毒技術(shù)規范》及實(shí)際應用經(jīng)驗，三十萬(wàn)級取2.55ppm（5mg/m3），萬(wàn)級取5ppm（10mg/m3），萬(wàn)級取15ppm（30mg/m3）、百級取20ppm（40mg/m3）。當然在使用中應根據潔凈室實(shí)際使用情況決定臭氧的濃度，并作相應的驗證工作。計算實(shí)際臭氧消毒體積時(shí)，應包括三部分V＝V1＋V2＋V3，V1潔凈區空間體積，V2空氣凈化系統體積，V3補充新風(fēng)量造成臭氧損失的有效體積，實(shí)際計算過(guò)程中V3等于循環(huán)系統總風(fēng)量的1.1％。