1、經(jīng)濟性方面
（1）對于高級別的生物安全實(shí)驗室，由于其造價(jià)昂貴，不宜盲目攀比建設，避免造成浪費。在立項建造生物安全實(shí)驗室前，首先應對實(shí)驗室的主要用途，基本的性能指標，以及建造實(shí)驗室的目的等有透徹的了解。要根據試驗對象的危害性確定生物安全實(shí)驗室的等級，不能盲目的追求高等級，因為級別越高，建造和運行費用也越高。
（2）要平衡初次投資和運行費用之間的關(guān)系，不能只追求很低的初投資，選擇廉價(jià)的設備或簡(jiǎn)易的系統形式，而忽略了運行費用，避免出現建得起而用不起的尷尬情況。設計時(shí)要進(jìn)行壽命周期費用（life cycle costing）分析方法，經(jīng)技術(shù)經(jīng)濟分析后選擇合理、經(jīng)濟的設計方案。
2、平面布局的問(wèn)題
過(guò)于繁瑣的平面布局，只能增加使用中的不便，并不能真正起多少實(shí)際作用；照搬國外簡(jiǎn)單的實(shí)驗室布局，也不符合中國的環(huán)境特點(diǎn)和管理水平。一些實(shí)際工程由于平面布局不合理，增加了初投資和管理難度，有的影響了實(shí)驗室內的空氣潔凈度。因此，一個(gè)完善合理的布局非常重要，這就要求業(yè)主和設計方要有對生物安全的充分理解以及相互之間的充分溝通。
3、設備備用問(wèn)題
(1)沒(méi)有設置備用電源。如三級生物安全實(shí)驗室要求雙路獨立供電，或采用備用發(fā)電機組，而四級生物安全試驗室要求有第三備用電源。條件不具備時(shí)需要另設不間斷電源，不間斷電源的供電能力要求不少于45分鐘。有的三級生物安全試驗室僅采用普通市政供電，沒(méi)有任何備用措施，顯然不滿(mǎn)足要求。
(2)排風(fēng)機的備用問(wèn)題。為了保證實(shí)驗室內在任何情況下都保持負壓，三級、四級生物安全實(shí)驗室的排風(fēng)系統要求應設置備用排風(fēng)機，但很多工程沒(méi)有設置。更有甚者排風(fēng)系統沒(méi)有備用風(fēng)機，但送風(fēng)設置了備用風(fēng)機。
4、系統的調節和控制功能
系統的調節和控制功能。為了嚴格保證實(shí)驗室內各個(gè)區域內的壓差和壓力梯度，送風(fēng)和排風(fēng)系統上應安裝必要的風(fēng)量調節裝置，而不能用普通調節閥代替。有些工程生物安全柜和房間的排風(fēng)沒(méi)有經(jīng)過(guò)嚴格的設計計算，在系統調試時(shí)不能滿(mǎn)足設計要求的壓力梯度，或壓力梯度不穩定。
沒(méi)有完善的自控系統，缺少應對突發(fā)事件的能力，也是目前已竣工實(shí)驗室的一個(gè)主要問(wèn)題。雖然竣工驗收時(shí)各區域的壓力梯度可以調整到滿(mǎn)足要求，但在實(shí)際運行過(guò)程中，由于高效過(guò)濾器阻力變化，缺乏專(zhuān)業(yè)運行管理人員等原因，沒(méi)有自控系統的實(shí)驗室不能確保壓力梯度。因此必須重視生物安全實(shí)驗室的自控系統。
5、要重視工程檢測
生物安全實(shí)驗室竣工后，首先應經(jīng)過(guò)國家授權的檢測機構的檢測，這是很重要的一個(gè)環(huán)節。檢測的內容應包括實(shí)驗室的嚴密程度、各個(gè)房間之間的負壓值、空氣氣流流向、高效過(guò)濾器檢漏、潔凈度級別、自控系統等多個(gè)方面。
6、其他注意事項
嚴禁把生物安全實(shí)驗室建成正壓實(shí)驗室，應按規定安裝防火閥，嚴禁用凈化工作臺來(lái)代替生物安全柜，嚴禁用安全柜的排風(fēng)代替房間排風(fēng)等。普通凈化工作臺與生物安全柜工作原理和用途完全不同，根本無(wú)法保護人體免受微生物感染，這是十分危險的。