環(huán)境保護是我國的基本國策之一，我國境內一切基本建設項目和技術(shù)改造項目，以及區域開(kāi)發(fā)項目的設計、建設和生產(chǎn)都應當執行《中華人民共和國環(huán)境保護法》。
制藥廠(chǎng)的環(huán)境保護設計與編制應符合《中華人民共和國環(huán)境保護法》，并依據國務(wù)院環(huán)境保護委員會(huì )、國家計劃委員會(huì )、國家經(jīng)濟委員會(huì )（86）國環(huán)字第003號文《關(guān)于頒發(fā)“建設項目環(huán)境保護管理辦法”的通知》和國家計委國務(wù)院環(huán)委［87］國環(huán)字第002號文《建設項目環(huán)境保護設計規定》等法規進(jìn)行。
在制藥廠(chǎng)設計過(guò)程中通常采用的標準有:
1、環(huán)境質(zhì)量標準《大氣環(huán)境質(zhì)量標準，《GB3095-1996》的二級標準，《城市區域環(huán)境噪聲標準，GB3096-93》的2類(lèi)標準。
2、污染物排放標準《污水綜合排放標準，《GB 8978-1996》的一級標準，《大氣污染物綜合排放標準，GB16297-1996》的二級標準。
3、噪聲控制標準《工業(yè)企業(yè)廠(chǎng)界噪聲標準，GB12348-90》的Ⅱ類(lèi)區域標準和衛生部、國家勞動(dòng)總局頒發(fā)的《工業(yè)企業(yè)噪聲衛生標準p（試行草案）》
至此可見(jiàn)，環(huán)境保護設計不僅由環(huán)保專(zhuān)業(yè)執行，而且須由各專(zhuān)業(yè)提供條件并共同參與設計才能完成。其中工藝專(zhuān)業(yè)應相應地提供有關(guān)主要污染物和主要污染源（廢氣及其污染物廢水及其污染物固體廢棄物）、噪聲源及其強度作為環(huán)境保護設計依據。
1、制藥廠(chǎng)所在地區的環(huán)境現狀與工程概況；
2、主要保護措施及預期效果:a.廢氣治理及效果；b.廢水治理及效果；c.固體廢棄物處置；d.噪聲治理；
3、環(huán)境綠化；
4、環(huán)境管理與環(huán)境監測；
5、項目對周?chē)h(huán)境影響的估算。
項目建成后，要將完善本企業(yè)的環(huán)保管理制度作為環(huán)境保護工作的前提，結合本企業(yè)實(shí)際，制定“環(huán)境保護管理規定”，“廢水處理系統崗位責任制”，“執行GB8978-1996排放標準考核細則”，“車(chē)間和科室環(huán)境治理考核標準”等一系列規章制度，并把這些規章制度納入企業(yè)的管理標準，使環(huán)保工作做到有章可循。
要對所有廢水和廢氣排放點(diǎn)以及廢水處理設施排放口，定期進(jìn)行監測，嚴格控制達標排放。定期測試各廢水和廢氣處理設施的處理效率，發(fā)現問(wèn)題及時(shí)組織維修，所有處理設施都必須建立技術(shù)檔案。要求企業(yè)配備專(zhuān)職環(huán)保管理人員，負責環(huán)保工作。
凡排放有毒有害廢水、廢氣、廢渣（液）、惡臭、噪聲、放射性元素等物質(zhì)或因素的建設項目，嚴禁在城市規劃確定的生活居住區、文教區、水源保護區、名勝古跡、風(fēng)景游覽區、溫泉、療養區和自然保護區等界區內選址。鐵路、公路等的選線(xiàn)，應盡量減輕對沿途自然生態(tài)的破壞和污染。排放有毒有害氣體的建設項目應布置在生活居住區污染系數最小方位的上風(fēng)側；排放有毒有害廢水的建設項目應布置在當地生活飲用水水源的下游；廢渣堆置場(chǎng)地應與生活居住區及自然水體保持規定的距離。環(huán)境保護設施用地應與主體工程用地同時(shí)選定。產(chǎn)生有毒有害氣體、粉塵、煙霧、惡臭、噪聲等物質(zhì)或因素的建設項目與生活居住區之間，應保持必要的衛生防護距離，并采取綠化措施。建設項目的總圖布置，在滿(mǎn)足主體工程需要的前提下，宜將污染危害最大的設施布置在遠離非污染設施的地段，然后合理地確定其余設施的相應位置，盡可能避免互相影響和污染。新建項目的行政管理和生活設施，應布置在靠近生活居住區的一側，并作為建設項目的非擴建端。建設項目的主要煙囪（排氣筒），火炬設施，有毒有害原料、成品的貯存設施，裝卸站等，宜布置在廠(chǎng)區常年主導風(fēng)的下風(fēng)側。制藥廠(chǎng)應有綠化設計，其綠化覆蓋率可根據建設項目的種類(lèi)不同而異。城市內的建設項目應按當地有關(guān)綠化規劃的要求執行。
制藥廠(chǎng)環(huán)境保護工程設計應因地制宜地采用行之有效的治理和綜合利用技術(shù)，同時(shí)輔之各種有效措施以避免或抑制污染物的無(wú)組織排放。如:
1、設置專(zhuān)用容器或其他設施，用以回收采樣、溢流、事故、檢修時(shí)排出的物料或廢棄物；
2、設備、管道等必須采取有效的密封措施防止物料跑、冒、滴、漏
3、粉狀或散裝物料的貯存、裝卸、篩分、運輸等過(guò)程應設置抑制粉塵飛揚的設施。