對于藥廠(chǎng)設計來(lái)說(shuō)，實(shí)驗動(dòng)物房設置空調凈化系統的目的是維持室內溫、濕度要求和保證室內空氣質(zhì)量。由于實(shí)驗動(dòng)物房?jì)仍试S的相對濕度變化范圍較大，多數實(shí)驗動(dòng)物房在一般情況下都能滿(mǎn)足要求。因此，大部分地區的實(shí)驗動(dòng)物房可以不考慮濕度控制設備。但在我國北方地區，冬季室外空氣的含濕量較低，如無(wú)加濕裝置則可能滿(mǎn)足不了室內相對濕度的要求，需要在空調系統中設置干蒸汽加濕器或其他型式的加濕裝置。由于控濕費用較高，國內多數單位不單獨考慮控濕問(wèn)題，而是通過(guò)日常的運行管理，使實(shí)驗動(dòng)物房的室內相對濕度維持在一定的范圍之內。如實(shí)驗動(dòng)物房的日常清洗，擦拭可以形成較大的散濕面積及散濕量。此外，實(shí)驗動(dòng)物的正常生理活動(dòng)也有一定量的產(chǎn)濕，如動(dòng)物的小便等。這些產(chǎn)濕量可以改善室內的相對濕度，使實(shí)驗動(dòng)物房滿(mǎn)足對濕度的要求。
在藥廠(chǎng)設計中，保持室內空氣質(zhì)量是實(shí)驗動(dòng)物房空調凈化系統的一個(gè)主要任務(wù)。潔凈度的控制可從三個(gè)方面著(zhù)手:
1）污染源控制減少污染物發(fā)散量；
2）通風(fēng)控制:利用干凈的空氣稀釋室內污染物的濃度；
3）凈化控制:濾除空氣中的污染物質(zhì)。
實(shí)驗動(dòng)物房需要控制的污染物主要是微生物及動(dòng)物新陳代謝的產(chǎn)物等，它們來(lái)自動(dòng)物本身。因此，對污染源的控制只能在一定范圍內起作用。所以實(shí)驗動(dòng)物房的潔凈度控制應主要從通風(fēng)控制和凈化控制考慮。
實(shí)驗動(dòng)物房的空氣過(guò)濾系統，一般采用粗效、中效、高效三級過(guò)濾。過(guò)濾器一般不采用木框架。因為木框架經(jīng)不起消毒，而且，易吸潮滋生細菌。過(guò)濾器的安裝方式、設計及施工應便于消毒和更新，而且，應保證其密封性。排風(fēng)系統應格外注意排風(fēng)口出風(fēng)方向及位置，并宜安裝過(guò)濾器以防止室外空氣倒灌。為了減少對大氣的污染，排風(fēng)需要進(jìn)行脫臭處理。污染區的排風(fēng)除根據情況選用中效過(guò)濾器或高效過(guò)濾器（HEPA）處理外，還應根據其危害程度采用殺菌燈高溫滅菌裝置或活性炭過(guò)濾器等雙重或三重措施。由于實(shí)驗動(dòng)物房?jì)鹊奈廴疚飼?huì )腐蝕排風(fēng)或回風(fēng)道，因此，風(fēng)道材料宜選用玻璃鋼、聚氯乙烯板或其他防腐材料，而不宜選用金屬材料。
在藥廠(chǎng)設計中，當實(shí)驗動(dòng)物設施采用屏障系統時(shí)，空調凈化系統的末端過(guò)濾器原則上應選用高效過(guò)濾器（HEPA）。實(shí)驗動(dòng)物可能要在屏障系統中連續飼養幾年。即使在高效過(guò)濾器前設置粗、中效過(guò)濾器，高效過(guò)濾器的壽命仍有可能短于飼養時(shí)間。因此，應設計備用過(guò)濾器裝置和相應的連接管道，以便在飼養過(guò)程中通過(guò)切換方式來(lái)替換達到終阻力的高效空氣過(guò)濾器。
在藥廠(chǎng)設計中，當實(shí)驗動(dòng)物設施采用亞屏障系統時(shí)，其空調系統與實(shí)驗動(dòng)物設施采用屏障系統的空調凈化系統沒(méi)有明顯的區別。只是采用亞屏障系統時(shí)，其空調凈化系統的末級過(guò)濾器的效率可適當降低，如采用亞高效或高中效空氣過(guò)濾器。
在藥廠(chǎng)設計中，當實(shí)驗動(dòng)物設施采用開(kāi)放系統時(shí)，允許使用風(fēng)機盤(pán)管處理回風(fēng)。但再循環(huán)送風(fēng)方式不僅容易滋生微生物，而且，會(huì )導致臭氣的傳播，使用效果不理想。